安全保卫处是在校党委、行政的领导和上级相关机关业务指导下，开展校安全保卫工作的职能部门，依据国家有关法律法规和学院规章制度，负责学校的综合治理、治安管理、消防管理、户籍管理、校卫队等工作。
  在学校领导的高度重视和各学院、各部门支持以及师生员工的积极配合下，安保处工作多年来取得了显著成绩。多次受到南通市公安局表彰，荣获南通市文化保卫工作“先进集体”称号。2006年被市公安局、市教育局、市综治委授予“最安全学校”称号。2007年获得省级“安全文明校园”称号， 2010年被授予“江苏省平安校园”称号。2013年2月保卫处被省公安厅记“集体二等功”。2015年被市公安局授予“二零一五年度机关企事业单位治安保卫工作先进集体”称号，2015年被市教育局授予“2015年度南通市学校安全管理工作先进集体”。2017年获得“江苏省平安校园建设示范高校”称号。2018年荣获江苏省第七届大学生安全知识竞赛优秀组织奖。2019年被省公安厅记全省单位治安保卫工作集体三等功。

学校认真学习贯彻上级有关要求，制定并完善相关规章制度，以及校级《突发公共事件应急预案》（包括火灾事故突发事件处置预案、群体打架斗殴突发事件处置预案、重大盗窃案件突发事件处置预案、群体上访突发事件处置预案、危险品泄漏突发事件处置预案、食物中毒突发事件处置预案、传染病突发事件处置预案、敌对、宗教势力渗透事件处置预案），在部门、系（部）层面，根据“谁主管（办），谁负责”的原则，建立健全部门工作制度、安全管理制度和突发事件应急预案，为校园安全稳定提供了制度保证。